Εσωτερικός «πόλεμος» προέκυψε στον Ηρόδοτο, με το Δ.Σ. της ομάδας να καταφέρεται δημόσια ενάντια στη διοίκηση των Νέων Ηροδότου, την οποία όπως επισημαίνει στην ανακοίνωσή του, δεν εμπιστεύεται και δεν αναγνωρίζει. Τονίζει μάλιστα ότι θέτει εμπόδια στην προσπάθεια ανασυγκρότησης του συλλόγου που ξεκίνησε πριν από μερικούς μήνες.
Αναλυτικά η αιχμηρή ανακοίνωση του Δ.Σ. του Ηροδότου:
«Η διοίκηση ΠΑΣΑ Ηροδότου, έχει καθήκον και αποστολή να υπηρετεί και να υποστηρίζει τα συμφέροντα του ενιαίου Ηροδότου, που περιλαμβάνει τις ακαδημίες, τα τμήματα υποδομής και τη μεγάλη ποδοσφαιρική ομάδα.Δυστυχώς την καταστατική αυτή υποχρέωση και καθήκον της διοίκησης, δεν αποδέχονται και δεν υπηρετούν όλοι, όσο και όπως θα έπρεπε. Μετά από αυτό και παρά τις πολύμηνες προσπάθειες μας για την εξασφάλιση του ενιαίου του Ηροδότου, βρισκόμαστε στη δυσάρεστη θέση να ανακοινώσουμε ότι ο Ηρόδοτος πλέον δεν εμπιστεύεται και δεν συνεργάζεται με τη "φερόμενη ως διοίκηση " των Νέων Ηροδότου, ούτε συμφωνεί με ενέργειες, αποφάσεις και συμπεριφορές αυτής, ενέργειες που δεν δεσμεύουν τον σύλλογό μας. Τους ποδοσφαιριστές της ομάδας αυτής, ως αθλητές προερχόμενους από τις Ακαδημίες Ηροδότου, τους θεωρούμε παίκτες του συλλόγου και η διοίκηση θα είναι πάντα κοντά τους, όπως και στους γονείς τους.Σε αυτή την χρονική συγκυρία δεν θα επιτρέψουμε σε κανένα να ανακόψει την προσπάθεια αναδιοργάνωσης, αναγέννησης και ανάκαμψης του ιστορικού συλλόγου».